עימותים קשים כעת בשכם בעקבות מטען רב עוצמה שהופעל כלפי ג'יפ צבאי של צה"ל. בעקבות העימותים הוזנקו לעיר יחידות מיוחדות, ומסוקי יסעור הגיעו לסביבה לסייע בפינוי הנפגעים שהאירוע שפרטיו מאופלים בשלב זה.
דיווחים שהגיעו בתחילה ממתפללים במתחם הקבר סיפרו על עצירה של האוטובוסים שטרם נכנסו אל העיר ונעצרו כתוצאה מהתקרית שהחלה עוד בטרם כניסת המתפללים אל העיר ואל מתחם ציון הקבר. אך בהודעה מועצה אזורית שומרון ומנהלת הקבר נמסר כי ממשיכים לחכות עד הכניסה.
ח"כ צבי סוכות מסר: "עיכוב בדרך לקבר יוסף הצדיק בשכם בעקבות אירוע ביטחוני. מתפללים מכל הלב לשלום חיילי ומפקדי צה"ל שמאבטחים את הכניסה. את הטרור חייבים לרסק.צבלי להפסיק לרגע".
שרת המשימות הלאומיות, אורית סטרוק מסרה: אירועי שכם הלילה הם התוצר הבלתי נמנע, המדמם, והכואב, של הפרוטוקולים של ממשלת אוסלו שנחשפו בלילה שעבר. אבו מאזן וחבר מרעיו לא הגיעו לכאן כדי "לנקות את הרחובות של שכם", אלא כדי למלא אותם בטרור. חייבים לצאת מהקונספציה של אוסלו! להכיר באויב, ולחסל את היכולות שלו".
הזרוע הצבאית של הג'יהאד האיסלאמי קיבלה אחריות לפיצוץ מטען החבלה